20 Ang mga tool na Open-source ay Makatutulong sa COVID-19 Cure Research

Ang mga pamahalaan, siyentipiko, at mga institusyon ng pananaliksik ay gumagamit ng teknolohiya at makabagong ideya upang malutas ang COVID-19.


Nabuo ang mga bukas na mapagkukunan ng mapagkukunan, at ang ilan ay patuloy na nasubok upang suportahan ang mga pagsisikap na na-deploy upang mabawasan ang mga kinalabasan ng nakamamatay na virus na ito.

Ang isang saklaw ng mga tool na open-source ay nasa lugar na, na tumutulong sa mga mananaliksik na malaman ang tungkol sa sakit, pagkilala sa pagkalat, pag-iwas sa pagkalat, at pagliit ng karagdagang pagkalat at pagkamatay. Ang isang hanay ng mga proyekto ay magagamit sa Edukasyon sa Ekosistema na binabalangkas kung paano gamitin ang iba’t ibang mga tool.

Ang artikulong ito ay titingnan ang ilan sa mga bukas na mapagkukunan at mga aklatan na ginagamit sa pagsubaybay, pag-iwas at pagkubkob, pagsusuri, at paggamot ng COVID-19.

COVID-19 Pagsubaybay sa Mapa

Noong Enero, inilunsad ang Center para sa Science Science at Engineering ng JHU COVID-19 Global Pagsubaybay sa Mapa na mabilis na naging isang mapagkakatiwalaang pang-internasyonal na mapagkukunan ng nagbabago na data ng pandemya sa real-time.

Ang mapa ay bukas na mapagkukunan at ginamit sa mga pagsisikap sa pagsasaliksik at paggunita ng kapangyarihan ng mga nangungunang organisasyon ng media, maliit na samahan, at lokal na pamahalaan.

DXY-COVID-19-Crawler

Ang DXY-COVID-19-Crawler ay isa sa mga pinakaunang bukas na mapagkukunang proyekto na binuo upang tumugon sa COVID-19 noong Enero.

Ginawa ng mga developer ang data mula sa DXY.cn, isang site na ginamit ng mga dalubhasang medikal na Tsino upang mag-ulat at subaybayan ang mga kaso. Bumuo sila ng isang web crawler na nakolekta ng data mula sa site at ginawang magagamit sa pamamagitan ng isang API at isang bodega ng data. Ang code ay magagamit sa Github.

Buksan ang Data Kit

Buksan ang Data Kit (ODK) ay hindi isang bagong tool. Ginamit ito bago ang pagsiklab ng Ebola sa West Africa noong 2004 at ang mas kamakailan na pagsiklab sa Demokratikong Republika ng Congo noong 2019.

Higit sa lahat ay tumutulong sa mga gumagamit na mangolekta, pamahalaan, at gumamit ng data sa pagsubaybay sa contact, estratehikong pagmamapa, suporta sa pagpapasya, pagiging sensitibo ng komunidad, at pamamahala ng kaso.

Ang pamayanan ng ODK ay higit pang isinulong ang paggamit nito bilang tugon sa COVID-19 sa pamamagitan ng paglaan ng isang form ng pag-uulat sa mga paglawak nito. Ang form ay idinisenyo ayon sa protocol ng World Health Organization para sa mga pagsisiyasat sa mga kaso at pagsubaybay sa pakikipag-ugnay at pagsisiyasat.

Nag-aalok din ang mga nangungunang developer ng libreng suporta para sa anumang samahan na nagtalaga ng ODK bilang tugon sa COVID-19.

Nextstrain

Nextstrain sinusubaybayan ang ebolusyon ng mga pathogens. Dati itong ginamit upang maipalabas ang kasaysayan ng pamilya ng isang sakit, samakatuwid ay nagpapagana ng hula sa paglala ng sakit.

Matagumpay itong ginamit sa mga nakaraang epidemya, tulad ng Ebola. Sa pamamagitan ng genetic data mula sa Global Initiative sa Pagbabahagi ng Lahat ng Data ng Influenza (Gisaid), ginagamit ang Nextxtrain upang matugunan ang COVID-19.

DHIS2

Marahil ay alam mo na DHIS2. Ito ang pinakamalaking sistema sa Pamamahala ng Impormasyon sa Kalusugan sa mundo. Ginagamit ito sa higit sa 70 mga bansa. Bilang bahagi ng tugon sa COVID-19, pinakawalan ng DHIS2 ang isang digital data package na nagpapabilis sa pagtuklas ng impeksyon, pag-uulat, pagsubaybay, at paggamot ng sakit.

Ginagamit ng DHIS2 digital data package ang karaniwang metadata na nakahanay sa protocol ng WHO sa COVID-19 case definition at pagbabantay upang paganahin ang mabilis na paglawak at pagtugon.

Pikobar West Java

Ang Impormasyon at Coordination Center para sa Sakit at Disaster ng Indonesia ay isang sentro ng pagtugon sa krisis na nabuo upang mabawasan at tumugon sa COVID-19 sa lalawigan ng West Java ng Indonesia.

Ang Jabar Digital Service ay, bilang bahagi ng tugon, binuo ng isang bukas na mapagkukunan ng web tool at app na nagbibigay-daan sa mga gumagamit na ma-access ang pinakabagong data ng COVID-19.

OpenMRS

Ang OpenMRS ay isang sistema ng pangangalaga ng pasyente na ginagamit sa maraming mga umuunlad na bansa sa buong mundo. Dahil sa kakayahang umangkop ng OpenMRS system, ang mga bansa na nagkaroon ng kanilang mga mapagkukunang pangkalusugan na nakaayos ay maaaring magamit ito para sa pagsubaybay, screening, at paggamot ng COVID-19.

Makakatulong ang system sa kanila na mapalawak ang kanilang kakayahan sa pamamagitan ng pagbibigay sa kanila ng access sa impormasyon na nakabase sa pang-agham sa pagharap sa krisis.

OpenLMIS

Ang OpenLMIS proyekto Gumagamit ng isang taktika na nakatuon sa komunidad upang makabuo ng isang bukas na mapagkukunan at isang nababagay na sistema ng impormasyon sa pamamahala ng logistik. Ang sistema ng OpenLMIS ay naglalayong mapagbuti ang katumpakan ng data, dagdagan ang pananagutan, mapabuti ang pagiging maaayos ng data, at kakayahang makita.

Ang sistema ng OpenLMIS ay naglalayong mapahusay ang mga supply ng kadena ng kalusugan, ang imbentaryo ng mga mapagkukunang medikal upang magbigay ng isang malinaw na larawan ng mga magagamit na mga medikal na suplay, kabilang ang mga pagsubok kit, at mga PPE (personal na kagamitan sa proteksiyon). Ang tool na ito ay maaaring epektibong maipadala upang suportahan ang mga gumagawa ng desisyon sa paglalaan ng mga mapagkukunan bilang tugon sa COVID-19.

Mga Kalusugan

Ang Pagmamapa ng Pandaigdigang Pangkalusugan ng Global ay isang proyekto na naglalayong mapa sa bawat pasilidad ng kalusugan sa mundo at ginagawang madaling ma-access ang mga detalye ng bawat ospital. Ang data sa mga pasilidad sa kalusugan ay na-access sa pamamagitan ng isang API.

Sa pamamagitan ng pakikipagtulungan sa mga gumagamit, kinukuha at pinatunayan ng koponan ng healthsites.io ang lokasyon at mga detalye ng contact ng bawat pasilidad sa kalusugan at malayang magagamit ang data at mai-access sa pamamagitan ng isang Open Data Lisensya.

SORMAS

SORMAS (Pamamahala sa Paglabas ng Surveillance outbreak Response at System System) ay isang bukas na mapagkukunan ng mobile e-health system. Inilipat ito upang ipatupad ang control control pati na rin ang mga pamamaraan sa pamamahala ng outbreak.

Ito ay epektibong na-deploy sa ilang mga bansa, kabilang ang Ghana, Nigeria, Nepal, at Fiji, para sa pagsubaybay sa COVID-19 at maagang pagtuklas..

Ang SORMAS ay isang libre, bukas na mapagkukunan ng sistema na sumusunod sa mga pamantayan ng proteksyon ng data.

Tokyo COVID-19

Hindi tulad ng maraming iba pang mga lungsod at pamahalaan, ang Pamahalaan ng Tokyo Metropolitan ay bumuo ng isang bukas na mapagkukunan ng website na nagpapabatid sa mga residente tungkol sa COVID-19. Sa pamamagitan ng paggawa ng bukas na mapagkukunan nito, nakita ng site ang mga kontribusyon mula sa higit sa 200 mga gumagamit. Tatlong iba pang mga lungsod, ang Chiba, Nagano, at Fukuoka, ay muling nakapagbuhay sa website.

OpenELIS

Ang layunin ng Sistema ng kalusugan ng OpenELIS ay upang mapagbuti ang pangangalaga sa kalusugan sa pamamagitan ng pagbibigay ng isang progresibo, pamantayan na batay sa sistema ng pamamahala ng impormasyon sa laboratoryo na maaaring magamit ng iba’t ibang mga inisyatibo sa kalusugan upang mapabuti ang mga pagpipilian sa paggamot.

Ang pagsiklab ng COVID-19 ay nagpakita ng isang pandaigdigang hamon ng pagsubaybay sa contact at pagsusuri ng masa sa mga pinaghihinalaang kaso. Ang sistemang OpenELIS ay maaaring epektibong maipadala sa paghawak sa COVID-19 upang mapadali ang pagsubaybay sa mga pagsubok at resulta ng laboratoryo.

Toolkit ng Kalusugan ng Komunidad

Ang Toolkit ng Kalusugan ng Komunidad ay isang koleksyon ng mga open-source tool pati na rin ang bukas na mga mapagkukunan ng pag-access na target na bumuo at mag-deploy ng mga digital na tool para magamit sa mga inisyatibo sa kalusugan ng komunidad sa mga lugar na mahirap maabot.

Ang pamayanan ng Community Health Toolkit developer ay nagpakilos upang makabuo ng mga tool at mapagkukunan na naglalayong suportahan ang mga manggagawa sa kalusugan ng komunidad upang harapin ang COVID-19.

CHIME

Ang COVID-19 Model sa Epekto ng Ospital para sa Epidemics (CHIME) ay isang open-source application na binuo ng mga data scientist sa Penn Medicine – University of Pennsylvania. Ito ay isang online na tool na nagbibigay-daan sa mga ospital upang mahulaan ang epekto ng virus sa mga mapagkukunan ng pangangalaga sa kalusugan.

Ito ay binuo gamit ang Python at ang pandas bukas na mapagkukunan na umaasa.

COVID Care Map

Ang COVID Care Map Tumutulong sa pagma-map sa mayroon nang mga mapagkukunang pangangalaga sa kalusugan at sa pagtataya ng mga puwang sa mga kama sa ospital, bentilador, suplay ng medikal, at kawani. Ang lahat ng mga pamamaraan, mga tool sa pagproseso ng data, visualizations, at source code ay libre at open-source.

Ang proyekto ng COVID Care Map ay naglalayong asahan at kumilos upang ipatawag ang suporta upang epektibong alagaan ang mabilis na dumaraming bilang ng mga impeksyon sa COVID-19 at ang mga nangangailangan ng masinsinang pangangalaga.

Locale.ai

Ang Locale.ai ay nakabuo ng isang open-source, interactive visualization ng lahat ng nakumpirma na mga kaso ng COVID-19 sa buong mundo. Hinihingi nito ang bukas na mapagkukunan ng mga datos mula sa John Hopkins University.

Binuo ni Locale.ai ang COVID-19 visualization website sa pamamagitan ng paggamit ng Vue.js, na kung saan ay isang tanyag na balangkas na nagpapahintulot sa mga developer na lumikha ng mga modernong web apps.

COVID-19 sa buong mundo

Ang app na ito Ginagamit ang isang visualization ng mapa upang masubaybayan ang pagkalat ng COVID-19, ang kumpirmadong mga kaso, at ang pag-unlad ng sakit sa buong mundo. Ginagawa nitong paggamit ng data mula sa John Hopkins CSSE.

Coronavirus tracker

Ito ay isang makintab na app na binuo ni John Coene. Sinusubaybayan nito ang pagkalat ng COVID-19 sa pamamagitan ng paggamit ng data mula sa John Hopkins, DXY data, at Weixin. Ipinapakita ng app ang bilang ng mga pinaghihinalaang, nakumpirma, at nakuhang mga kaso sa pamamagitan ng oras at rehiyon. Ang code ay magagamit sa Github.

COVID-19 Global Cases

COVID-19 Global Cases ay isang makintab na app na binuo ni Christoph Schoenenberger na nagpapakita ng mga pagpapaunlad ng COVID-19 sa isang mapa, plots, mga talahanayan ng buod, at mga numero. Ang code nito ay magagamit sa Github.

Mga Pamahalaan at COVID-19

Ito ay isang makintab na app na binuo ng Sebastian Engel-Wolf. Inilalagay nito ang mapa ng paglago ng COVID-19, mga araw upang doble ang impeksyon, nakumpirma na mga kaso, dami ng namamatay, at ang bilang ng mga kumpirmadong kaso bawat 100,000 katao sa iba’t ibang mga rehiyon. Ang code ay magagamit sa Github.

Pag-wrap up

Ang bukas na mapagkukunan ng komunidad ay mabilis na tumugon at epektibo sa pandamdam ng COVID-19. Maraming mga proyekto ang itinayo at patuloy na itinatayo upang harapin ang pagkalat ng sakit. Inilalarawan ng artikulong ito ang ilan sa mga proyekto. Mayroon pa ring kawalan ng katiyakan tungkol sa kung paano ang sakit ay umunlad sa mga darating na linggo. Marami pang mga proyekto na maaaring magamit ang umiiral na mga teknolohiya ng open-source ay makakahanap ng isang lugar sa paglaban sa nakamamatay na sakit na ito.

Manatiling ligtas!

Artikulo ni Dr. Michael J. Garbade, CEO, Edukasyon sa Edukasyon

Jeffrey Wilson Administrator
Sorry! The Author has not filled his profile.
follow me
    Like this post? Please share to your friends:
    Adblock
    detector
    map